产品货号:
KL260114
中文名称:
RNA结合蛋白免疫沉淀试剂盒
英文名称:
RNA Binding Protein Immunoprecipitation Kit
产品规格:
6T
发货周期:
1~3天
产品价格:
询价
简要说明:
产品组成:
保存:-20℃,有效期1年。
用户自备:
去离子水、BCA蛋白浓度测定试剂盒、0.22mm注射器式滤膜
使用方法:
相关搜索:RNA结合蛋白免疫沉淀试剂盒,RIP试剂盒,RNA Binding Protein Immunoprecipitation Kit
RIP技术(RNA Binding Protein Immunoprecipitation)是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络动态过程的有力工具。该技术主要是运用目标蛋白的特异性抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,然后经过分离纯化对结合在复合物上的RNA进行qPCR验证或者高通量测序分析。
产品组成:
| 组分 | 规格 |
| RIP裂解缓冲液 | 2.4mL |
| 100×蛋白酶抑制剂 | 15μL |
| RNA酶抑制剂 | 35μL |
| 蛋白A/G磁珠 | 200μL |
| 1mg/mL正常兔IgG | 30μL |
| 1mg/mL正常鼠IgG | 30μL |
| RIP洗涤缓冲液 | 50μL |
| 0.5M EDTA | 400μL |
| 盐溶液 | 600μL |
| DEPC水 | 400μL |
| 洗脱缓冲液 | 800μL |
保存:-20℃,有效期1年。
用户自备:
去离子水、BCA蛋白浓度测定试剂盒、0.22mm注射器式滤膜
使用方法:
- 样本前处理
- 准备405μL完全RIP裂解缓冲液(400μL RIP裂解缓冲液+4μL 100×蛋白酶抑制剂+1μL RNA酶抑制剂)
- 动物细胞:
- 收集2×107个细胞样品,加入2mL PBS洗涤细胞,离心后弃上清收集细胞沉淀,预留1/4的细胞样品用于后续input组的RNA提取及纯化。
- 向剩余细胞沉淀中加入400μL完全RIP裂解缓冲液重悬,并用移液枪吹打混匀10次,使细胞充分裂解,冰浴30min,每10min涡旋一次,10s/次,4℃ 12000rpm离心10min,取上清,记为裂解产物,并按照150μL(IP)、150μL(IgG)、100μL(input)分成三份,input样本-80℃保存备用。
- 收集2×107个细胞样品,加入2mL PBS洗涤细胞,离心后弃上清收集细胞沉淀,预留1/4的细胞样品用于后续input组的RNA提取及纯化。
- 动物组织:
- 取新鲜组织或低温组织(约0.3g),置于预冷的研钵中,加入液氮进行快速研磨至粉末状,并收集到2管无RNase的离心管中,1管约1/4的组织样品预留用于后续input组的RNA提取及纯化。
- 向另一管组织粉末中加入400μL完全RIP裂解缓冲液重悬沉淀,用移液枪吹打混匀10次,使组织充分裂解,冰浴30min,每10min涡旋一次,10s/次,4℃ 12000rpm离心10min,取上清,记为裂解产物,并按照150μL(IP)、150μL(IgG)、100μL(input)分成三份,input样品-80℃保存备用。
- 取新鲜组织或低温组织(约0.3g),置于预冷的研钵中,加入液氮进行快速研磨至粉末状,并收集到2管无RNase的离心管中,1管约1/4的组织样品预留用于后续input组的RNA提取及纯化。
- 磁珠准备
- 准备2支1.5mL EP管,分别标记IgG管和IP管,将蛋白A/G磁珠原管上下颠倒10次,待磁珠和液体混匀后,分别取出30μL到IgG管和IP管。
- 每管加入300μL RIP洗涤缓冲液,用移液枪吹打混匀5次,置于磁力架上静置1min,弃上清,该步骤操作3次。
- 用300μL的RIP洗涤缓冲液重悬磁珠。
- 准备2支1.5mL EP管,分别标记IgG管和IP管,将蛋白A/G磁珠原管上下颠倒10次,待磁珠和液体混匀后,分别取出30μL到IgG管和IP管。
- 磁珠结合抗体
- IP管加入3~5μg目的抗体,IgG管加入3~5μg目的抗体相同宿主的IgG,放到静音混合器上室温孵育60min。
- 将两管放到磁力架上静置1min,弃上清。加入300μL RIP洗涤缓冲液,用移液枪吹打混匀5次,在磁力架上静置1min,弃上清,该步骤操作3次。
- IP管加入3~5μg目的抗体,IgG管加入3~5μg目的抗体相同宿主的IgG,放到静音混合器上室温孵育60min。
- RNA结合蛋白免疫沉淀
- 准备1.8mL RIP缓冲液(1720μL RIP洗涤缓冲液+70μL 0.5M EDTA+10μL RNA酶抑制剂);向步骤C所得的IgG管和IP管中分别加入900μL RIP缓冲液,150μL步骤A所得裂解产物,放到静音混合器上,4℃孵育过夜。
- 将两管放到磁力架上静置1min,弃上清;将两管各加入300μL RIP洗涤缓冲液,用移液枪吹打混匀5次,在磁力架上静置1min,弃上清,该步骤操作5次。
- 将两管各加入300μL RIP洗涤缓冲液,用移液枪吹打混匀5次,取100μL混合液到新管,标记为A管,剩余液体记为B管,将4管置于磁力架上静置1min,弃上清,A管加100μL洗脱缓冲液,煮沸10min后磁力架上静置1min,取上清到新管,加入10μL 6×上样缓冲液混匀准备WB检测,B管用于纯化RNA,分组设置见下表:
实验组 RIP洗涤缓冲液 样本名称 体积 实验 lgG 300μL lgG-A 100μL WB检测 lgG-B 200μL RNA纯化 IP 300μL IP-A 100μL RNA纯化 IP-B 200μL RNA纯化
- 准备1.8mL RIP缓冲液(1720μL RIP洗涤缓冲液+70μL 0.5M EDTA+10μL RNA酶抑制剂);向步骤C所得的IgG管和IP管中分别加入900μL RIP缓冲液,150μL步骤A所得裂解产物,放到静音混合器上,4℃孵育过夜。
- RNA纯化
- 步骤A预留的input样品和步骤D的IgG-B管与IP-B管中各加入500μL的TrizoL,涡旋混匀,室温静置5min,再加入100μL的氯仿,涡旋混匀,4℃ 14000rpm离心10min,取上层水相(约300μL)到新管,做好标记。
- 加入50μL盐溶液,550μL异丙醇混匀,-80℃静置2~4h(亦可静置过夜),使用前放置4℃解冻。
- 4℃ 14000rpm离心10min,弃上清,加入500μL 75%乙醇,4℃ 14000rpm离心10min,小心弃掉上清,该步操作3次。
- 开盖室温晾干,加10~20μL DEPC水,移液枪吹打,使RNA完全溶解,-80℃保存备用。
- 步骤A预留的input样品和步骤D的IgG-B管与IP-B管中各加入500μL的TrizoL,涡旋混匀,室温静置5min,再加入100μL的氯仿,涡旋混匀,4℃ 14000rpm离心10min,取上层水相(约300μL)到新管,做好标记。
- RIP-qPCR(选作步骤)
- 逆转录:按照逆转录试剂盒进行操作。
- 反应程序:将Input、IP、IgG逆转录后cDNA分别取1μL加入到PCR反应孔中,每个样品三复孔,其余组分按照SYBR Green qPCR Mix说明书进行添加,加完后做好标记瞬时离心10 s,放入荧光定量PCR仪中上机检测。详细点样方式如下(阳性样本只做GAPDH引物确认是否富集即可):
1 2 3 4 5 6 7 8 9 引物1 B input input input IgG IgG IgG IP IP IP 引物2 C input input input IgG IgG IgG IP IP IP ... ... input input input IgG IgG IgG IP IP IP - 结果计算:Fold Enrichment=2^(△△Ct)(以lgG为参照)
△△Ct=(Ct Ip-Ct input)-(Ct lgc-Ct input)=×(input组目标基因Ct input值作为参照Ct值)则目标基因的IP组表达水平为lgG组的2的负x次方倍。
- 逆转录:按照逆转录试剂盒进行操作。
相关搜索:RNA结合蛋白免疫沉淀试剂盒,RIP试剂盒,RNA Binding Protein Immunoprecipitation Kit
